RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	STX16	O14662	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	ANP32C	O43423	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	MBD4	O95243	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	PEPD	P12955	493 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	CTGF	P29279	349 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	TM4SF1	P30408	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	CXCR5	P32302	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	ELF1	P32519	619 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	MCM5	P33992	734 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	SEC24C	P53992	1094 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	DDR1	Q08345	913 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	MPP3	Q13368	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	FOXE3	Q13461	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	USP51	Q70EK9	711 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	RFK	Q969G6	155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	PIGS	Q96S52	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM2-223	ENST00000536089	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TISP43	B9A030	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TSPAN3	O60637	253 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	PDE8B	O95263	885 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	SERPINB2	P05120	415 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CHRNA5	P30532	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GRIA3	P42263	894 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CDK7	P50613	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	RCAN1	P53805	252 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CHRND	Q07001	517 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CDSN	Q15517	529 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	HTRA1	Q92743	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	SLX4	Q8IY92	1834 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CYR61	O00622	381 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF213	O14771	459 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	NKX2-8	O15522	239 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	KLK10	O43240	276 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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