RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533413.5

CKAP5-212, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CKAP5, Length 3,084 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-212ENST00000533413 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CIITAP33076 1130 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 EMP3P54852 163 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 HPCAP84074 193 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 DNAJC3Q13217 504 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ZNF460Q14592 562 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SLC9A9Q8IVB4 645 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 DNAJC9Q8WXX5 260 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SLCO2A1Q92959 643 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CD101Q93033 1021 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 C9orf72Q96LT7 481 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 PCDHB18PQ96TA0 734 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 GHITMQ9H3K2 345 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 STOML1Q9UBI4 398 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ATPIF1Q9UII2 106 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ANAPC7Q9UJX3 599 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 VAV3Q9UKW4 847 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 NUDT19A8MXV4 375 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SLITRK3O94933 977 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CDK4P11802 303 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 FOXN2P32314 431 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 PTGS2P35354 604 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 PPM1AP35813 382 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 DPP6P42658 865 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 DSTNP60981 165 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CAP1Q01518 475 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 RUNX1T1Q06455 604 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SLC14A1Q13336 389 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 TLR1Q15399 786 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CYP4X1Q8N118 509 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CPA6Q8N4T0 437 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 EFHBQ8N7U6 833 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ZNF565Q8N9K5 539 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 XXYLT1Q8NBI6 393 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 METTL21AQ8WXB1 218 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 TRIB2Q92519 343 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 LENG9Q96B70 501 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ITPKCQ96DU7 683 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ACCSQ96QU6 501 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 HSD17B14Q9BPX1 270 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 RHBGQ9H310 441 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CRTAC1Q9NQ79 661 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CHST7Q9NS84 486 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 KCND2Q9NZV8 630 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CLEC4AQ9UMR7 237 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.55□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 KPNA5O15131 536 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 PROM1O43490 865 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 EXTL3O43909 919 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 B4GALT4O60513 344 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CYBAP13498 195 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 KRT5P13647 590 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CD46P15529 392 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CYP2B6P20813 491 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CA4P22748 312 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 MARK3P27448 753 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 MLH1P40692 756 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 MAGEA4P43358 317 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 CLCN4P51793 760 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 DLG4P78352 724 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 PPP3CAQ08209 521 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 ALCAMQ13740 583 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 TAF12Q16514 161 aa5.54□□□□□ -1.52
CKAP5-212ENST00000533413 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
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