RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 TAZQ16635 292 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 MEI1Q5TIA1 1274 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 MBLAC2Q68D91 279 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ADIPOR2Q86V24 386 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 KDM1BQ8NB78 822 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 CLDN23Q96B33 292 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 RNF157Q96PX1 679 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 FOXQ1Q9C009 403 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 CIPCQ9C0C6 399 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 HPCAL4Q9UM19 191 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 JRKLQ9Y4A0 524 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ATG2BQ96BY7 2078 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 PRRT4C9JH25 899 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ATG13O75143 517 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP19.17■□□□□ 0.664e-7■□□□□ 9.7
PTPRK-218ENST00000525459 CDKN2BP42772 138 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ATP13A1Q9HD20 1204 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 OR51B4Q9Y5P0 310 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 RAD54BQ9Y620 910 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 TRIOO75962 3097 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 KMT2EQ8IZD2 1858 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGAP42A6NI28 874 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 DLDP09622 509 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 AMPD1P23109 780 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 VASPP50552 380 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 MESP2Q0VG99 397 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 MMRN1Q13201 1228 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 RPS6KA1Q15418 735 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 SLC9A4Q6AI14 798 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC49Q8IUZ0 686 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 PCDH19Q8TAB3 1148 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 PBXIP1Q96AQ6 731 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ALG14Q96F25 216 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 LMAN1LQ9HAT1 526 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 NDFIP2Q9NV92 336 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A13Q9UJS0 675 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 PLA2G4CQ9UP65 541 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 MUC3AQ02505 3323 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 RNF40O75150 1001 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 NNMTP40261 264 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 AFMIDQ63HM1 303 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 RETSATQ6NUM9 610 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 MFSD7Q6UXD7 560 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 FBXL6Q8N531 539 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 OR52K2Q8NGK3 314 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ALG3Q92685 438 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 CARD9Q9H257 536 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 CHRDQ9H2X0 955 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC19Q9H756 370 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0D9SEW6 157 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 USP27XA6NNY8 438 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 RASA4BC9J798 803 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 APOL1O14791 398 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 RASA4O43374 803 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ST8SIA6P61647 398 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ECT2LQ008S8 904 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF569Q5MCW4 686 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM215Q68D42 235 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 IL31Q6EBC2 164 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 RFX6Q8HWS3 928 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 APCDD1Q8J025 514 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 USP33Q8TEY7 942 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 EPHX3Q9H6B9 360 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 SLC8A2Q9UPR5 921 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 TGM2P21980 687 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 SLC20A2Q08357 652 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 FZD5Q13467 585 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 SEL1L2Q5TEA6 688 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 SDE2Q6IQ49 451 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 NPWQ8N729 165 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 KLC2Q9H0B6 622 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.66
PTPRK-218ENST00000525459 GPR37L1O60883 481 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRK-218ENST00000525459 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
PTPRK-218ENST00000525459 MX2P20592 715 aa19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.9 ms