RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	CHRNA5	P30532	468 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	PPM1A	P35813	382 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	ENTPD1	P49961	510 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	RASSF2	P50749	326 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	PKP1	Q13835	747 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	KEAP1	Q14145	624 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	SPARCL1	Q14515	664 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	ERAP2	Q6P179	960 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	AAGAB	Q6PD74	315 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760		Q6ZSV7	163 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760		Q6ZTC4	211 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	RNF144B	Q7Z419	303 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	ELP5	Q8TE02	316 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	APOLD1	Q96LR9	279 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	MEIS3	Q99687	375 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	DCLK3	Q9C098	648 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	CHST12	Q9NRB3	414 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CDK1-208	ENST00000519760	GAGE12J	A6NER3	117 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	OR6C75	A6NL08	312 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	STMND1	H3BQB6	276 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	CAND2	O75155	1236 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	LCK	P06239	509 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PICALM	Q13492	652 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	STARD3	Q14849	445 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	DUSP6	Q16828	381 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM60	Q495X7	471 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	LRRC24	Q50LG9	513 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	MTFR2	Q6P444	385 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	VPS52	Q8N1B4	723 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	TNIP3	Q96KP6	325 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	HIPK3	Q9H422	1215 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760		Q9N2J8	555 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760		A0A0A0MQY5	61 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	GRM8	O00222	908 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	LARGE1	O95461	756 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	ITGB8	P26012	769 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	SERPINB3	P29508	390 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	TYK2	P29597	1187 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	TEC	P42680	631 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PPP3CC	P48454	512 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PNLIPRP1	P54315	467 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	EGR4	Q05215	589 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	CDK18	Q07002	472 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PTK2B	Q14289	1009 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	HNF4G	Q14541	408 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	GALNTL6	Q49A17	601 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	MORC1	Q86VD1	984 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	FAM71B	Q8TC56	605 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	KCNJ9	Q92806	393 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PHF21B	Q96EK2	531 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	SELENON	Q9NZV5	590 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	NFU1	Q9UMS0	254 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	DAPP1	Q9UN19	280 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	CKAP5	Q14008	2032 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	ACOT8	O14734	319 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	FFAR2	O15552	330 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	LIAS	O43766	372 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PPP1R3D	O95685	299 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	MYL1	P05976	194 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	THPO	P40225	353 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	STAT1	P42224	750 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	CYP2J2	P51589	502 aa		3.19	□□□□□ -1.9

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