RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519474.5

HDAC3-215, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 736 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HDAC3-215ENST00000519474 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.6□□□□□ -0.87
HDAC3-215ENST00000519474 C10orf142B7Z368 130 aa9.6□□□□□ -0.87
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HDAC3-215ENST00000519474 SCML1Q9UN30 329 aa9.6□□□□□ -0.87
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HDAC3-215ENST00000519474 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.59□□□□□ -0.87
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HDAC3-215ENST00000519474 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.59□□□□□ -0.87
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HDAC3-215ENST00000519474 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.59□□□□□ -0.87
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HDAC3-215ENST00000519474 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HDAC3-215ENST00000519474 A0A1W2PP55 124 aa9.58□□□□□ -0.88
HDAC3-215ENST00000519474 A0A1W2PQC6 194 aa9.58□□□□□ -0.88
HDAC3-215ENST00000519474 ILVBLA1L0T0 632 aa9.58□□□□□ -0.88
HDAC3-215ENST00000519474 SYCE3A1L190 88 aa9.58□□□□□ -0.88
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