RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519254.2

CLN8-204, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-204ENST00000519254 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN8-204ENST00000519254 RAD54BQ9Y620 910 aa14.85□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.85□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.85□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 AP1B1Q10567 949 aa14.85□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 SPATA13Q96N96 652 aa14.85□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.84□□□□□ -0.03
CLN8-204ENST00000519254 MANEALQ5VSG8 457 aa14.84□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.84□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 DENND1CQ8IV53 801 aa14.84□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.84□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 GALNT2Q10471 571 aa14.83□□□□□ -0.03
CLN8-204ENST00000519254 SEMA5AQ13591 1074 aa14.83□□□□□ -0.03
CLN8-204ENST00000519254 TPSAB1Q15661 275 aa14.83□□□□□ -0.03
CLN8-204ENST00000519254 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.83□□□□□ -0.03
CLN8-204ENST00000519254 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.83□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.83□□□□□ -0.03
CLN8-204ENST00000519254 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.83□□□□□ -0.03
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CLN8-204ENST00000519254 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 E9PAM4 449 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 NCAM2O15394 837 aa14.83□□□□□ -0.04
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CLN8-204ENST00000519254 POU2F2P09086 479 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 SSTR1P30872 391 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 AVPR1AP37288 418 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 MMP13P45452 471 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 PPARDQ03181 441 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 DMTNQ08495 405 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 CCDC38Q502W7 563 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-204ENST00000519254 ZNF534Q76KX8 674 aa14.83□□□□□ -0.04
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