RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM61Q5EBN2 209 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PYROXD2Q8N2H3 581 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 STK40Q8N2I9 435 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF214Q8ND24 703 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 OR7D4Q8NG98 312 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 NETO1Q8TDF5 533 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 FRS2Q8WU20 508 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 CPLX3Q8WVH0 158 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRN2Q92932 1015 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf74Q96LT6 269 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPY26PQ9H489 355 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 NDFIP2Q9NV92 336 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS51Q9UID3 782 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQJ5 194 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFS2O75306 463 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ACADMP11310 421 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 MAOBP27338 520 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMD8P48556 350 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 MAMLD1Q13495 774 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ARID5BQ14865 1188 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SPDYCQ5MJ68 293 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 LRSAM1Q6UWE0 723 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC31Q6UY01 552 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SYT12Q8IV01 421 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DRC7Q8IY82 874 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM1BQ8NB78 822 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 EDEM3Q9BZQ6 932 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 K7ERQ8 282 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 MID1O15344 667 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 LRIG2O94898 1065 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 MT-CO1P00395 513 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 IRX4P78413 519 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 LINGO4Q6UY18 593 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZVU0 165 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 NLRP14Q86W24 1093 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 NTAN1Q96AB6 310 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF653Q96CK0 615 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ZYG11BQ9C0D3 744 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 FBRSQ9HAH7 460 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 OR12D3Q9UGF7 316 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SUN2Q9UH99 717 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A13Q9UJS0 675 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTL7AQ9Y615 435 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SPTBN2O15020 2390 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SHROOM3Q8TF72 1996 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DCDC2BA2VCK2 349 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 MEI4A8MW99 385 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 PLK4O00444 970 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC30A4O14863 429 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DNTTP04053 509 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SRCP12931 536 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1E1P30953 314 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SULT2A1Q06520 285 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SCAPQ12770 1279 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CST6Q15828 149 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 STPG1Q5TH74 334 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DCAF12L1Q5VU92 463 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DCUN1D2Q6PH85 259 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 TMC6Q7Z403 805 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SH2D3CQ8N5H7 860 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 AADATQ8N5Z0 425 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DCAF4L2Q8NA75 395 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 PEBP4Q96S96 227 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM129BQ96TA1 746 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP58Q9BVL2 599 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPN11Q9UMQ6 739 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PP55 124 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP9BO43861 1147 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 FTLP02792 175 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CFIP05156 583 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP14P31944 242 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ACVRL1P37023 503 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 OXCT1P55809 520 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBED6P86452 979 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL13BQ3SXY8 428 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf118Q5T5N4 469 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SCYL2Q6P3W7 929 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 CNPY3Q9BT09 278 aa19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms