RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497287.5

GPATCH4-208, Transcript of G-patch domain containing 4, human

TSL 3

Gene GPATCH4, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH4-208	ENST00000497287	GFRA2	O00451	464 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	MATN3	O15232	486 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	OPHN1	O60890	802 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	NEBL	O76041	1014 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	PRAMEF12	O95522	483 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	RHOC	P08134	193 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	IGFBP4	P22692	258 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	IVD	P26440	423 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	FDFT1	P37268	417 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ETFB	P38117	255 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	MTHFR	P42898	656 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	IRAK1	P51617	712 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	CLCN6	P51797	869 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ITGA8	P53708	1063 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	OXCT1	P55809	520 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	MORF4L2	Q15014	288 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	TRADD	Q15628	312 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	MPP7	Q5T2T1	576 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	HOOK3	Q86VS8	718 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	DDI1	Q8WTU0	396 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	SMARCD2	Q92925	531 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ART4	Q93070	314 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	FATE1	Q969F0	183 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	HMCES	Q96FZ2	354 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	SPATA13	Q96N96	652 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	FMO2	Q99518	471 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	SP110	Q9HB58	689 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	CLDND1	Q9NY35	253 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	OBP2A	Q9NY56	170 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	CCL26	Q9Y258	94 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	CHAD	O15335	359 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	MAFK	O60675	156 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	JCHAIN	P01591	159 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	MYBL2	P10244	700 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	CCNB1	P14635	433 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	PTPN3	P26045	913 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ECHS1	P30084	290 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	IFNAR2	P48551	515 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	LMAN1	P49257	510 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	RENBP	P51606	427 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	SGSH	P51688	502 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	GNA12	Q03113	381 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	IL10RB	Q08334	325 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	WASHC5	Q12768	1159 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	SERINC3	Q13530	473 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	CDH18	Q13634	790 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	PARP6	Q2NL67	630 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	TEX44	Q53QW1	395 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	IL31	Q6EBC2	164 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	PID1	Q7Z2X4	250 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GPATCH4-208	ENST00000497287	MFN1	Q8IWA4	741 aa		7.47	□□□□□ -1.21

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