RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491711.5

PDSS1-204, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDSS1, Length 897 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-204ENST00000491711 LNP1A1A4G5 178 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 RHOBTB1O94844 696 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 SDHAP31040 664 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 GJA4P35212 333 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 FLT3P36888 993 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 ALDH1A3P47895 512 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 CD300LGQ6UXG3 332 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 USP37Q86T82 979 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 C11orf74Q86VG3 221 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 ACACAQ13085 2346 aa7□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.99□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 CCDC169A6NNP5 214 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 C4orf47A7E2U8 309 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 BTBD18B2RXH4 712 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 MED24O75448 989 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 PRAMEF12O95522 483 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 APBB3O95704 486 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 CAVIN2O95810 425 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 OR4Q2P0C623 313 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 MCF2P10911 925 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 KCNE1P15382 129 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 CYP11B2P19099 503 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 AMPD3Q01432 767 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 BFSP1Q12934 665 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 STRN3Q13033 797 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 STK38Q15208 465 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 PLK5Q496M5 336 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 C16orf92Q96LL3 132 aa6.99□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 EMC7Q9NPA0 242 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 KCND1Q9NSA2 647 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 ASB3Q9Y575 518 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 CLIC4Q9Y696 253 aa6.99□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.99□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 MTMR11A4FU01 709 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 K7ERI5 159 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 YEATS4O95619 227 aa6.98□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 ODC1P11926 461 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 CEACAM1P13688 526 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 ZNF28P17035 718 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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PDSS1-204ENST00000491711 MCM7P33993 719 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 AVPR1AP37288 418 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 ME1P48163 572 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 GLRBP48167 497 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 TAF12Q16514 161 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 FBXO43Q4G163 708 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 XKR4Q5GH76 650 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 VASNQ6EMK4 673 aa6.98□□□□□ -1.29
PDSS1-204ENST00000491711 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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