RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TACR3P29371 465 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 MTNR1AP48039 350 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 IL13RA2Q14627 380 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 BRINP3Q76B58 766 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 RRM2BQ7LG56 351 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 MDGA2Q7Z553 956 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 CPLX4Q7Z7G2 160 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 NGEFQ8N5V2 710 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 EXD3Q8N9H8 876 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 FAM47BQ8NA70 645 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 KAT2BQ92831 832 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SAAL1Q96ER3 474 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 EPHX3Q9H6B9 360 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 FSD2A1L4K1 749 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 MGST3O14880 152 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 PER2O15055 1255 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 FOXN1O15353 648 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SCGB1D1O95968 90 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 COX7A2P14406 83 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 IDUAP35475 653 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 STAT1P42224 750 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ERV3-1Q14264 604 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA3AQ14563 771 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZPA2 131 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 RTL10Q7L3V2 364 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 MON1AQ86VX9 555 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 KLBQ86Z14 1044 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF347Q96SE7 839 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 MPP6Q9NZW5 540 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SARDHQ9UL12 918 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 KCNJ18B7U540 433 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 TIPRLO75663 272 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 RNF8O76064 485 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC3BP05452 202 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 URODP06132 367 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 UFM1P61960 85 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 RNF144BQ7Z419 303 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SARAFQ96BY9 339 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 LMAN2LQ9H0V9 348 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 DHDHQ9UQ10 334 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 DYTNA2CJ06 578 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 CCNDBP1O95273 360 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 TYK2P29597 1187 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ARL3P36405 182 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SOX2P48431 317 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SLC18A3Q16572 532 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC89Q8N998 374 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 METTL6Q8TCB7 284 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 PIGKQ92643 395 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 OR6C68A6NDL8 312 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 MATN3O15232 486 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 KRT4P19013 534 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ABCD1P33897 745 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 AWAT1Q58HT5 328 aa8.28□□□□□ -1.08
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