RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	GNA12	Q03113	381 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	OCA2	Q04671	838 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CAPS	Q13938	189 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CEACAM7	Q14002	265 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CSHL1	Q14406	222 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	STXBP2	Q15833	593 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TEX44	Q53QW1	395 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	URGCP	Q8TCY9	931 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	GAB3	Q8WWW8	586 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MAML3	Q96JK9	1138 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF778	Q96MU6	729 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	EBF1	Q9UH73	591 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	HES2	Q9Y543	173 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MRAS	O14807	208 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PMM2	O15305	246 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SURF1	Q15526	300 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	VPS72	Q15906	364 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF410	Q86VK4	478 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM192	Q8IY95	271 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ALS2	Q96Q42	1657 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TSHR	P16473	764 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DMPK	Q09013	629 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	POU6F1	Q14863	301 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PDK2	Q15119	407 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DHFR2	Q86XF0	187 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CBR4	Q8N4T8	237 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	IPMK	Q8NFU5	416 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A087WXM4	84 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	NEMP2	A6NFY4	417 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC36	A6NLP5	189 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	UBD	O15205	165 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SUPT7L	O94864	414 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CNTF	P26441	200 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC7A2	P52569	658 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CNTN2	Q02246	1040 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	AHI1	Q8N157	1196 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	H6PD	O95479	791 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PGAM1	P18669	254 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	AP3M2	P53677	418 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SNX16	P57768	344 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	STX5	Q13190	355 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CTBP1	Q13363	440 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SNAPC2	Q13487	334 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PCSK7	Q16549	785 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	KBTBD6	Q86V97	674 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM17	Q9Y577	477 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ANGPT2	O15123	496 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MAN1A2	O60476	641 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNH1	O95259	989 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	LYPLA2	O95372	231 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MYL4	P12829	197 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MAG	P20916	626 aa		10	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	HSD17B4	P51659	736 aa		10	□□□□□ -0.81

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