RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 CAPN11Q9UMQ6 739 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 ITIH6Q6UXX5 1313 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 DOCK4Q8N1I0 1966 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 RTN2O75298 545 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 MT-CO1P00395 513 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 DNTTP04053 509 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 GZMAP12544 262 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 GLDCP23378 1020 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 OXTRP30559 389 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 OR1E1P30953 314 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ZBED6P86452 979 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ARID5BQ14865 1188 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ACCSLQ4AC99 568 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SPDYCQ5MJ68 293 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 MANEALQ5VSG8 457 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SYT12Q8IV01 421 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 DRC7Q8IY82 874 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PYROXD2Q8N2H3 581 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 OR7D4Q8NG98 312 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PTPRN2Q92932 1015 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PPP1R9BQ96SB3 815 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 CNPY3Q9BT09 278 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 TRIM7Q9C029 511 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 OSBPL2Q9H1P3 480 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 FBRSQ9HAH7 460 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 FSCN3Q9NQT6 498 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PARVAQ9NVD7 372 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 DLL3Q9NYJ7 618 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 VPS51Q9UID3 782 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SLC25A13Q9UJS0 675 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PI4KAP42356 2102 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 LNP1A1A4G5 178 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 K7ERQ8 282 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 MID1O15344 667 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 LRIG2O94898 1065 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 IGLV3-19P01714 112 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 TPM3P06753 285 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 MAOBP27338 520 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 CASP14P31944 242 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ACSL1P33121 698 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 NNMTP40261 264 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PSMD8P48556 350 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 IRX4P78413 519 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 DLG2Q15700 870 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 TRIM61Q5EBN2 209 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 C6orf118Q5T5N4 469 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 LINGO4Q6UY18 593 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 TMC6Q7Z403 805 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SLFN11Q7Z7L1 901 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 RGL4Q8IZJ4 473 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SH2D3CQ8N5H7 860 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 NETO1Q8TDF5 533 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 GANCQ8TET4 914 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 FRS2Q8WU20 508 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 NTAN1Q96AB6 310 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ZNF653Q96CK0 615 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 FAM129BQ96TA1 746 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SPON2Q9BUD6 331 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 EDEM2Q9BV94 578 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 NDFIP2Q9NV92 336 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 MYO1AQ9UBC5 1043 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SERGEFQ9UGK8 458 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ILVBLA1L0T0 632 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 DCDC2BA2VCK2 349 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 TMEM191CA6NGB0 347 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 MEI4A8MW99 385 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 CBFA2T2O43439 604 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 ATP9BO43861 1147 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 BNIP3LO60238 219 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SERPING1P05155 500 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 CFIP05156 583 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 C7P10643 843 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SRCP12931 536 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 PSMA2P25787 234 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-214ENST00000490425 SLC8A1P32418 973 aa12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms