RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 ZXDBP98169 803 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB17Q13105 803 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 PARP15Q460N3 678 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 GPR158Q5T848 1215 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TTC16Q8NEE8 873 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TCEAL4Q96EI5 215 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 SHROOM3Q8TF72 1996 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TTC4O95801 387 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 POU2F2P09086 479 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TPSB2P20231 275 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 LMAN1P49257 510 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 SLC29A2Q14542 456 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TPSAB1Q15661 275 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 Q6ZNB5 142 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 AGAP3Q96P47 875 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 MED4Q9NPJ6 270 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP97Q9P2B7 532 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 GREM1O60565 184 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 CLDN11O75508 207 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 PSMB4P28070 264 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 NRIP1P48552 1158 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ANO4Q32M45 955 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 FNBP1LQ5T0N5 605 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF354CQ86Y25 554 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 KRT222Q8N1A0 295 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TEKT5Q96M29 485 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF510Q9Y2H8 683 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 F5H423 210 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 OPA1O60313 960 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TSPAN3O60637 253 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 NUDT17P0C025 328 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 AVPR1AP37288 418 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 CDK16Q00536 496 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TEAD2Q15562 447 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 KYNUQ16719 465 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 DUSP6Q16828 381 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 CHST9Q7L1S5 443 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TNS4Q8IZW8 715 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 MCUQ8NE86 351 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 GBA3Q9H227 469 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 NINJ2Q9NZG7 142 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 RSPH14Q9UHP6 348 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 NFS1Q9Y697 457 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1B0GVM2 712 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TCAF2A6NFQ2 919 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ALOX15BO15296 676 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ACSL3O95573 720 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 IFFO1Q0D2I5 559 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 HTR3DQ70Z44 454 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZBED8Q8IZ13 594 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 C9orf72Q96LT7 481 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TTC25Q96NG3 672 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 TASP1Q9H6P5 420 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 SOBPA7XYQ1 873 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 SARNPP82979 210 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 CMTM8Q8IZV2 173 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 OR2W6PQ8NHA6 318 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 FATE1Q969F0 183 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 SERPINB12Q96P63 405 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 IL12RB2Q99665 862 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 SP110Q9HB58 689 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 PIDD1Q9HB75 910 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 DOCK6Q96HP0 2047 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 E7ESA3 106 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF197O14709 1029 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 MOSPD3O75425 235 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 NEBLO76041 1014 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 SGSHP51688 502 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 SLC5A9Q2M3M2 681 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 BBS9Q3SYG4 887 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 C6orf118Q5T5N4 469 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 USP33Q8TEY7 942 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 MAGEH1Q9H213 219 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-210ENST00000489475 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 EPOPA6NHQ4 379 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 LEFTY2O00292 366 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 NTHL1P78549 312 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 SERINC3Q13530 473 aa27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms