RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ACSS2Q9NR19 701 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 USP18Q9UMW8 372 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 C22orf31O95567 290 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 INSRRP14616 1297 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 EPHA3P29320 983 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GPD2P43304 727 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RGS7P49802 495 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TMEM53Q6P2H8 277 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GPR141Q7Z602 305 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TNS4Q8IZW8 715 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GPC2Q8N158 579 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TMEM176AQ96HP8 235 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 KLC2Q9H0B6 622 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 KANSL1LA0AUZ9 987 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 AMHP03971 560 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ZNF286BP0CG31 522 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MYL4P12829 197 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PHKA2P46019 1235 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SURF1Q15526 300 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 AMHR2Q16671 573 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SLC10A6Q3KNW5 377 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PPM1JQ5JR12 505 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 OGFOD2Q6N063 350 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 XKR5Q6UX68 686 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 C16orf89Q6UX73 402 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ATG14Q6ZNE5 492 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MPP5Q8N3R9 675 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 LPIN3Q9BQK8 851 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 COQ10BQ9H8M1 238 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ADA2Q9NZK5 511 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TNFSF13BQ9Y275 285 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TRIM17Q9Y577 477 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 HTR3EA5X5Y0 456 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SLC15A5A6NIM6 579 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TPP1O14773 563 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CHADO15335 359 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PRKCHP24723 683 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 C21orf59P57076 290 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TGFBIQ15582 683 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RCN3Q96D15 328 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ADPGKQ9BRR6 497 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 FAM96AQ9H5X1 160 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ZNF358Q9NW07 568 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 DNAJC28Q9NX36 388 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RNF11Q9Y3C5 154 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TRIP11Q15643 1979 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MED7O43513 233 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PLIN3O60664 434 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SERPINB7O75635 380 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ZBED1O96006 694 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ARRB2P32121 409 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 NDST1P52848 882 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 CRADDP78560 199 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 OR52B2Q96RD2 323 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SORT1Q99523 831 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MAGEB5Q9BZ81 275 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PNPLA8Q9NP80 782 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PAK5Q9P286 719 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 AKT3Q9Y243 479 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 FUOMA2VDF0 154 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 C7orf72A4D263 438 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 MATN2O00339 956 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 C1QAP02745 245 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 GRK2P25098 689 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 RBL1P28749 1068 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 KCTD2Q14681 263 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 TAZQ16635 292 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-212ENST00000488380 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms