RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGAP18Q8N392 663 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 GLIS1Q8NBF1 620 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 MZB1Q8WU39 189 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 EDEM1Q92611 657 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 HAUS1Q96CS2 278 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 PGLYRP2Q96PD5 576 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 CSPG4P5Q96PW8 444 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 USP29Q9HBJ7 922 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.835e-7■■■■□ 24.2
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 STK39Q9UEW8 545 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 INSL6Q9Y581 213 aa9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PQH9 124 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 A8MUI8 341 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 CAPN9O14815 690 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 IRAK2O43187 625 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 NEFHP12036 1026 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 CPB1P15086 417 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 ATF6P18850 670 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 TGM2P21980 687 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 ADRA1DP25100 572 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 YWHAQP27348 245 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 PPM1AP35813 382 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 GLUD2P49448 558 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 NEK3P51956 506 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 SLC18A2Q05940 514 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 DPYSQ14117 519 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 KRT81Q14533 505 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 NOMO1Q15155 1222 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC6Q16204 474 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 BBS9Q3SYG4 887 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 PYROXD2Q8N2H3 581 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 TCP10LQ8TDR4 215 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 STMN2Q93045 179 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 MCUR1Q96AQ8 359 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 RTP4Q96DX8 246 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 SLC39A13Q96H72 371 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM169Q96HH4 297 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 YME1L1Q96TA2 773 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 RAD9AQ99638 391 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 CALN1Q9BXU9 219 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.83□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
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POLR1A-208ENST00000486964 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.83□□□□□ -0.84
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POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PPM1 405 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.82□□□□□ -0.84
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POLR1A-208ENST00000486964 FAM72CH0Y354 149 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 DLL1O00548 723 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 SOAT2O75908 522 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 CTSAP10619 480 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 RBP3P10745 1247 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 ETS1P14921 441 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 CNTFP26441 200 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 EPHB2P29323 1055 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 VHLP40337 213 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 MAGEA6P43360 314 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 NR2C2P49116 596 aa9.82□□□□□ -0.84
POLR1A-208ENST00000486964 PSEN1P49768 467 aa9.82□□□□□ -0.84
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