RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 OR14C36Q8NHC7 312 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SLC2A13Q96QE2 648 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CDC6Q99741 560 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 VPS16Q9H269 839 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SIX2Q9NPC8 291 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 PLCB1Q9NQ66 1216 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 DDIT4Q9NX09 232 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SCML1Q9UN30 329 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 LHX6Q9UPM6 363 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CACNA1GO43497 2377 aa13.02□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTS20P59510 1910 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 DKK1O94907 266 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 IL1BP01584 269 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ERBB2P04626 1255 aa13.01□□□□□ -0.33
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PRAME-212ENST00000485532 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 PON1P27169 355 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 DRD3P35462 400 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ADPRHP54922 357 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CLDN6P56747 220 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 UBASH3AP57075 661 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 C21orf59P57076 290 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 PPP2CBP62714 309 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 RACK1P63244 317 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 PPP2CAP67775 309 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CDK17Q00537 523 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 NME3Q13232 169 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SHBQ15464 509 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 MAN2A1Q16706 1144 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 POM121L1PQ3SYA9 428 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 OR6B2Q6IFH4 312 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 C19orf48Q6RUI8 117 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 GBP6Q6ZN66 633 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 C14orf80Q86SX3 495 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 OR2T34Q8NGX1 318 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 FRS2Q8WU20 508 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SHC3Q92529 594 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 RNF34Q969K3 372 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ALG14Q96F25 216 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 TRIM62Q9BVG3 475 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 TRIM5Q9C035 493 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 APEX2Q9UBZ4 518 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SARDHQ9UL12 918 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 VANGL2Q9ULK5 521 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SNX10Q9Y5X0 201 aa13.01□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 LOC400499M0QZD8 3231 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PR77 199 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 LRRC72A6NJI9 287 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 LGALS16A8MUM7 142 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 C10orf142B7Z368 130 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 VILLO15195 856 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 TEX33O43247 280 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGA12O60330 932 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 RTN2O75298 545 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ADCY5O95622 1261 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 GOT1P17174 413 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ABCB4P21439 1286 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 GRK6P43250 576 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 AUHQ13825 339 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 EXOC3L4Q17RC7 722 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 PTPN20Q4JDL3 420 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 VWA3BQ502W6 1294 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 OLFML1Q6UWY5 402 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.334e-63■□□□□ 9
PRAME-212ENST00000485532 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SLC47A2Q86VL8 602 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ANLNQ9NQW6 1124 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 FZD4Q9ULV1 537 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGC3Q9UN70 934 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 HS3ST4Q9Y661 456 aa13□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GTQ1 180 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GVM2 712 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 TCAF2A6NFQ2 919 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 I6L893 689 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CBFA2T2O43439 604 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 TNFSF14O43557 240 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 HSF2BPO75031 334 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ADH1BP00325 375 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 C5AR1P21730 350 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CD38P28907 300 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CCR1P32246 355 aa12.99□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 CLCN1P35523 988 aa12.99□□□□□ -0.33
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