RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GPM6BQ13491 265 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NR1D2Q14995 579 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 USP41Q3LFD5 358 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 USP43Q70EL4 1123 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZNF398Q8TD17 642 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ART4Q93070 314 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CDH23Q9H251 3354 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SELENONQ9NZV5 590 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NDC80O14777 642 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PHF2O75151 1096 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 B3GALNT1O75752 331 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ETV3P41162 512 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TUBA1BP68363 451 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DLG4P78352 724 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 WASHC5Q12768 1159 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 MED21Q13503 144 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.159e-6■■□□□ 14.4
USP4-211ENST00000485450 PHKG1Q16816 387 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TUBA1AQ71U36 451 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PDSS2Q86YH6 399 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.87□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NOTOA8MTQ0 251 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GYG2O15488 501 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GAS8O95995 478 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TFPTP0C1Z6 253 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SLC5A2P31639 672 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GLUD2P49448 558 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 RBP5P82980 135 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GPR17Q13304 367 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CDONQ4KMG0 1287 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 RAB41Q5JT25 222 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 RTP2Q5QGT7 225 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CADM3Q8N126 398 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 EXD1Q8NHP7 514 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GIPC2Q8TF65 315 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 POF1BQ8WVV4 589 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NDE1Q9NXR1 346 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 H7C4K7 107 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 UQCRBP14927 111 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NR2F2P24468 414 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 IFITM2Q01629 132 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ASPHQ12797 758 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SPCS2Q15005 226 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ASIC2Q16515 512 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 BEND5Q7L4P6 421 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 BNIPLQ7Z465 357 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TMC8Q8IU68 726 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SKA1Q96BD8 255 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TTPALQ9BTX7 342 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DMTF1Q9Y222 760 aa7.86□□□□□ -1.15
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