RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471202.5

CHTF18-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 4,494 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-208ENST00000471202 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.76□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.76□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.76□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 LZICQ8WZA0 190 aa14.76□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SEPHS2Q99611 448 aa14.76□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.76□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 INPP4BO15327 924 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 YWHAQP27348 245 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 DHFR2Q86XF0 187 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PLD3Q8IV08 490 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 MICU2Q8IYU8 434 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PLD5Q8N7P1 536 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SCN3BQ9NY72 215 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 RAD54BQ9Y620 910 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 FAM155BO75949 473 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PACS1Q6VY07 963 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ADAM2Q99965 735 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 TEX12Q9BXU0 123 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SPASTQ9UBP0 616 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 33.4
CHTF18-208ENST00000471202 FASP25445 335 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ACOX2Q99424 681 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 OMDQ99983 421 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SYBUQ9NX95 663 aa14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 GPR25O00155 361 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 CCNB1P14635 433 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 BNIP1Q12981 228 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 WDR41Q9HAD4 459 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ITGB6P18564 788 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ATP6V1B2P21281 511 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 MAP3K10Q02779 954 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 FAM13CQ8NE31 585 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 MARK4Q96L34 752 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ACTR8Q9H981 624 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 CCDC166P0CW27 439 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 GRIA4P48058 902 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 CYP1B1Q16678 543 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SNX15Q9NRS6 342 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 FAM50BQ9Y247 325 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 AP4S1Q9Y587 144 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 GRIN2DO15399 1336 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 A8MUI8 341 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 HDAC3O15379 428 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 BIRC5O15392 142 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ARHGAP8P85298 464 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 KATNA1O75449 491 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms