RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 NKX3-2P78367 333 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 GALNT2Q10471 571 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CDH17Q12864 832 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 BLMHQ13867 455 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 NAA25Q14CX7 972 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 GSTA3Q16772 222 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MBLAC2Q68D91 279 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 IRGCQ6NXR0 463 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ZNF567Q8N184 647 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC9Q8WXX5 260 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 FATE1Q969F0 183 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MIEF2Q96C03 454 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SENP8Q96LD8 212 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 DEFB118Q96PH6 123 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 HAPLN3Q96S86 360 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 RBBP8Q99708 897 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SYT15Q9BQS2 421 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ACBD6Q9BR61 282 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 GBA3Q9H227 469 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 WDCPQ9H6R7 721 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 COPG2Q9UBF2 871 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SOX13Q9UN79 622 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 GINS2Q9Y248 185 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 NME7Q9Y5B8 376 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SPTLC1O15269 473 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 NVLO15381 856 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ADCY6O43306 1168 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MAP3K7O43318 606 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CREB3O43889 395 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MFSD11O43934 449 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CACNG3O60359 315 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TRIM13O60858 407 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 AP1G2O75843 785 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CABYRO75952 493 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PROCP04070 461 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CYP11A1P05108 521 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ODC1P11926 461 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 VAV1P15498 845 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PAMP19021 973 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 AKAP5P24588 427 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PTPN3P26045 913 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 GEMP55040 296 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 KLC1Q07866 573 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 LAMB3Q13751 1172 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 HIC1Q14526 733 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MUM1Q2TAK8 710 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ACCSLQ4AC99 568 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 RAB6CQ53S08 254 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 KCTD11Q693B1 232 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 RASSF3Q86WH2 238 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 GPATCH11Q8N954 259 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.69□□□□□ -1.02
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