RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	ETFDH	Q16134	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	HTRA1	Q92743	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454		A6NLC8	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	ADAM10	O14672	748 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PPEF2	O14830	753 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	MOSPD3	O75425	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TUB	P50607	506 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	SHC2	P98077	582 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	STAM	Q92783	540 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	CLPB	Q9H078	707 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PEX12	O00623	359 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	SOCS2	O14508	198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	ELF1	P32519	619 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	PGM1	P36871	562 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	OAZ1	P54368	228 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	METTL18	O95568	372 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	PRPH2	P23942	346 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	KRT9	P35527	623 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	STAT1	P42224	750 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	LIFR	P42702	1097 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	ADPRH	P54922	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	RABEP1	Q15276	862 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CLK1-208	ENST00000464454	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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