RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 IRX4P78413 519 aa24.62■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.62■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 STPG1Q5TH74 334 aa24.62■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.62■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 OR12D3Q9UGF7 316 aa24.62■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 CACNA1AO00555 2505 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 MEI4A8MW99 385 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 CCP110O43303 1012 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 CFIP05156 583 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 LIMK1P53667 647 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 WDR45BQ5MNZ6 344 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 ERMP1Q7Z2K6 904 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC185Q8N715 623 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 CADM4Q8NFZ8 388 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 CEP76Q8TAP6 659 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 GANCQ8TET4 914 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 OSBPL2Q9H1P3 480 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 PI4KAP42356 2102 aa24.61■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 LAMA1P25391 3075 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PQJ5 194 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 DCDC2BA2VCK2 349 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 KRT83P78385 493 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 DUOXA1Q1HG43 343 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 ACCSLQ4AC99 568 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 ARTNQ5T4W7 220 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 IL31Q6EBC2 164 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 RABEPKQ7Z6M1 372 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 STK40Q8N2I9 435 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRN2Q92932 1015 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 CNPY3Q9BT09 278 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 PARVAQ9NVD7 372 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 SCML1Q9UN30 329 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa24.6■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 GZMAP12544 262 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 VAV1P15498 845 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 DESP17661 470 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 ACSL1P33121 698 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 VASPP50552 380 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 MAMLD1Q13495 774 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 CST6Q15828 149 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 SLC23A3Q6PIS1 610 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 FRS2Q8WU20 508 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 NTAN1Q96AB6 310 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 IQCDQ96DY2 449 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 FAM129BQ96TA1 746 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 PSMB7Q99436 277 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 BTBD1Q9H0C5 482 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 TSPY26PQ9H489 355 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 NUMA1Q14980 2115 aa24.59■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 DOCK4Q8N1I0 1966 aa24.58■■□□□ 1.53
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SMKR1-201ENST00000462322 ILVBLA1L0T0 632 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 METTL12A8MUP2 240 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 MID1O15344 667 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 ATP9BO43861 1147 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 SNAP91O60641 907 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 TPM3P06753 285 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 MAOBP27338 520 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 ZBED6P86452 979 aa24.58■■□□□ 1.53
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SMKR1-201ENST00000462322 DLG2Q15700 870 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 DCAF12L1Q5VU92 463 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 USP30Q70CQ3 517 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 DRC7Q8IY82 874 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 SPON2Q9BUD6 331 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 FBXL12Q9NXK8 326 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 SUSD2Q9UGT4 822 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 VPS51Q9UID3 782 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 SLC6A14Q9UN76 642 aa24.58■■□□□ 1.53
SMKR1-201ENST00000462322 FAM72CH0Y354 149 aa24.57■■□□□ 1.52
SMKR1-201ENST00000462322 RTN2O75298 545 aa24.57■■□□□ 1.52
SMKR1-201ENST00000462322 SEMA4FO95754 770 aa24.57■■□□□ 1.52
SMKR1-201ENST00000462322 SERPINF2P08697 491 aa24.57■■□□□ 1.52
SMKR1-201ENST00000462322 GNSP15586 552 aa24.57■■□□□ 1.52
SMKR1-201ENST00000462322 SLC8A1P32418 973 aa24.57■■□□□ 1.52
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