RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-202ENST00000460160 FRS2Q8WU20 508 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-202ENST00000460160 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-202ENST00000460160 FAM129BQ96TA1 746 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-202ENST00000460160 PCED1AQ9H1Q7 454 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-202ENST00000460160 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-202ENST00000460160 SUSD2Q9UGT4 822 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-202ENST00000460160 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC53A6NM62 1247 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 MAPK8P45983 427 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 CST6Q15828 149 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 LUZP1Q86V48 1076 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 STK40Q8N2I9 435 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 BTBD1Q9H0C5 482 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 MUC3BQ9H195 1237 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SERGEFQ9UGK8 458 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SCML1Q9UN30 329 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 CHD5Q8TDI0 1954 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 MID1O15344 667 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SRGAP2O75044 1071 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SEMA4FO95754 770 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 RHOCP08134 193 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 NR1I3Q14994 352 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 USP30Q70CQ3 517 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 STRADAQ7RTN6 431 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 PSMB7Q99436 277 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 TTYH3Q9C0H2 523 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ATP9BO43861 1147 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINC1P01008 464 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 GNSP15586 552 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ADRA1BP35368 520 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 HDAC4P56524 1084 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 WDR59Q6PJI9 974 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 C1orf216Q8TAB5 229 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SGK2Q9HBY8 427 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 FBXL12Q9NXK8 326 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 A0A0D9SEW6 157 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP33O14559 1287 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 VPS51Q9UID3 782 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SNAP91O60641 907 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 PTMSP20962 102 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 GPD1P21695 349 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 KCNA4P22459 653 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 OR1E1P30953 314 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SLC8A1P32418 973 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 PSMD8P48556 350 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 UAP1L1Q3KQV9 507 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ARL13BQ3SXY8 428 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 MANEALQ5VSG8 457 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 GANCQ8TET4 914 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 OR12D3Q9UGF7 316 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 HS3ST2Q9Y278 367 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1B0GTW7 788 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1W2PP55 124 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 MT-CO1P00395 513 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 FANCCQ00597 558 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 DLG2Q15700 870 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ASIC2Q16515 512 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 ACCSLQ4AC99 568 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 AADATQ8N5Z0 425 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC185Q8N715 623 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 OR2I1PQ8NGU4 316 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SNX19Q92543 992 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 OSBPL2Q9H1P3 480 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-202ENST00000460160 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms