RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 FSCBQ5H9T9 825 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PID1Q7Z2X4 250 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 OR7D4Q8NG98 312 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 WFDC5Q8TCV5 224 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC45Q96CN5 670 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TTLL3Q9Y4R7 772 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A0A0MRY4 1105 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TBL1XO60907 577 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 MX2P20592 715 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 GLDCP23378 1020 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 RTL10Q7L3V2 364 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 NAT8LQ8N9F0 302 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA13Q96N96 652 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 LINC00597Q9H2U6 94 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 AVILO75366 819 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PSMB4P28070 264 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 GRIA1P42261 906 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 C5orf22Q49AR2 442 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CNTD1Q8N815 330 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 AZIN2Q96A70 460 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM161BQ96MY7 647 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 TDP1Q9NUW8 608 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 PAK5Q9P286 719 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP2-204ENST00000452765 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 NCAM2O15394 837 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 C1RP00736 705 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 APRTP07741 180 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MSS51Q4VC12 460 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 HTR3DQ70Z44 454 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 LZTR1Q8N653 840 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GORASP1Q9BQQ3 440 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 UBP1Q9NZI7 540 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 DPP7Q9UHL4 492 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RAMP2O60895 175 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 VIPR2P41587 438 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SFXN1Q9H9B4 322 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CCNB1P14635 433 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 HSD17B3P37058 310 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SPARCL1Q14515 664 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNJ11Q14654 390 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 GRIN2CQ14957 1233 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 HDXQ7Z353 690 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 PPIL6Q8IXY8 311 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RSPRY1Q96DX4 576 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 RAD54BQ9Y620 910 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 OR2W6PQ8NHA6 318 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SPON2Q9BUD6 331 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MAP2K7O14733 419 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 PEX11BO96011 259 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CCNCP24863 283 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 ETFBP38117 255 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 NDST2P52849 883 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CDH4P55283 916 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC10A7Q0GE19 358 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 MORF4L2Q15014 288 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TEX44Q53QW1 395 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-204ENST00000452765 DDI1Q8WTU0 396 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms