RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.49■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.49■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.49■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 ALG14Q96F25 216 aa20.49■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.49■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.49■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.49■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 KALRNO60229 2985 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 BECN2A8MW95 431 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 PLK4O00444 970 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC7A4O43246 635 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 ATP9BO43861 1147 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 GLI1P08151 1106 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 CCR1P32246 355 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 OXCT1P55809 520 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 STX17P56962 302 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 PAK1Q13153 545 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 FBXL22Q6P050 247 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 OXR1Q8N573 874 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 EID2Q8N6I1 236 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 SARDHQ9UL12 918 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 DOCK9Q9BZ29 2069 aa20.48■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 RTN2O75298 545 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 HNF1BP35680 557 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 NUDT1P36639 197 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 CLDN6P56747 220 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 CDK17Q00537 523 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 CENPCQ03188 943 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 BNIP3Q12983 259 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 AGBL4Q5VU57 503 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 IQCHQ86VS3 1027 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TRIM69Q86WT6 500 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 DEFB106AQ8N104 65 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 NXPE2Q96DL1 559 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 CPXM1Q96SM3 734 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 DDIT4Q9NX09 232 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 DMTF1Q9Y222 760 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.47■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 BIN1O00499 593 aa20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 HSF2BPO75031 334 aa20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 IRAK1P51617 712 aa20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 GJB7Q6PEY0 223 aa20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 MYLKQ15746 1914 aa20.46■□□□□ 0.87
GCSHP5-201ENST00000443090 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ALOX15BO15296 676 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 JUPP14923 745 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CNTN1Q12860 1018 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 OVGP1Q12889 678 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CRELD1Q96HD1 420 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM81BQ96LP2 452 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 COX16Q9P0S2 106 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 MCF2LO15068 1137 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 MTA1Q13330 715 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ILKQ13418 452 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 DLG2Q15700 870 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 C5orf22Q49AR2 442 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 HES3Q5TGS1 186 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 Q6ZVU0 165 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP5-201ENST00000443090 SHC3Q92529 594 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 197.8 ms