RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	PAGE1	O75459	146 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	PDGFRA	P16234	1089 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CXCR3	P49682	368 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	IRAK1	P51617	712 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	OXCT1	P55809	520 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPC	Q03188	943 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT31	Q15323	416 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CST6	Q15828	149 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	XYLT1	Q86Y38	959 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF34	Q969K3	372 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	BIRC7	Q96CA5	298 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM129B	Q96TA1	746 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		18.26	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	PLXNA2	O75051	1894 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM131	Q92545	1883 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	MID1	O15344	667 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	MME	P08473	750 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	NOMO3	P69849	1222 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SULT2A1	Q06520	285 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP4F3	Q08477	520 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF3	Q5VWG9	929 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	BNIPL	Q7Z465	357 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	C14orf80	Q86SX3	495 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ADCY5	O95622	1261 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GGCX	P38435	758 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	KLK7	P49862	253 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF19	Q2TAC6	998 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ARTN	Q5T4W7	220 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TRNP1	Q6NT89	227 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ARC	Q7LC44	396 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ERICH1	Q86X53	443 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF677	Q86XU0	584 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	FRS2	Q8WU20	508 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GBP4	Q96PP9	640 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	VPS16	Q9H269	839 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	WDCP	Q9H6R7	721 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	FANCL	Q9NW38	375 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM51	Q9NW97	253 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	FZD4	Q9ULV1	537 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PP55	124 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFSF14	O43557	240 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN11	O75508	207 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	F9	P00740	461 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV4-34	P06331	123 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CD27	P26842	260 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	FLT3	P36888	993 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	NNMT	P40261	264 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SULT1E1	P49888	294 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	GALC	P54803	685 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CDH4	P55283	916 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	JAM2	P57087	298 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMK2B	Q13554	666 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	TEAD4	Q15561	434 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	C2CD6	Q53TS8	623 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	STK40	Q8N2I9	435 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MRPL28-203	ENST00000429738	SNX19	Q92543	992 aa		18.23	■□□□□ 0.51

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