RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423113.5

ITGB1-205, Transcript of integrin subunit beta 1, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene ITGB1, Length 3,729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGB1-205	ENST00000423113	KRT6B	P04259	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CKB	P12277	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	KCNE1	P15382	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CYP3A5	P20815	502 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ANXA13	P27216	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	GNG2	P59768	71 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CDK16	Q00536	496 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	KRT17	Q04695	432 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	KCNA1	Q09470	495 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	MPP2	Q14168	576 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	PON2	Q15165	354 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	NRF1	Q16656	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	PHKG1	Q16816	387 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CENPU	Q71F23	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	UBR7	Q8N806	425 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	FAR2	Q96K12	515 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113		A0A1W2PQ72	361 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TSPAN4	O14817	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TTC4	O95801	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	RBP3	P10745	1247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	MAG	P20916	626 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TEC	P42680	631 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	NR4A2	P43354	598 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ARL4C	P56559	192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CENPC	Q03188	943 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CD300C	Q08708	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	NEDD8	Q15843	81 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	HTRA1	Q92743	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113		A0A1W2PPW3	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	PDXK	O00764	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	SNPH	O15079	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	TSPAN1	O60635	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	INSRR	P14616	1297 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ADRA1D	P25100	572 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	LRPAP1	P30533	357 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	AKR1D1	P51857	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	ITGA8	P53708	1063 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	CDH15	P55291	814 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	PDK4	Q16654	411 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITGB1-205	ENST00000423113	POTEG	Q6S5H5	508 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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