RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCAF2A6NFQ2 919 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E5RJQ4 531 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT1P36639 197 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTP5Q14D33 572 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEA1Q16626 185 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENND1BQ6P3S1 775 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQCHQ86VS3 1027 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK32AQ8WU08 396 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRS2Q8WU20 508 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8D1Q8WZ84 308 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KREMEN1Q96MU8 473 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DMTF1Q9Y222 760 aa13.57□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNU1A8MYU2 1149 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEC1O60732 1142 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTN2O75298 545 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT5P13647 590 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CKMT2P17540 419 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLK1P53350 603 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OVGP1Q12889 678 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RABGAP1LQ5R372 815 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGBL4Q5VU57 503 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM46CQ5VWP2 391 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSG4Q86SJ6 1040 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM69Q86WT6 500 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EHBP1Q8NDI1 1231 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFFLQ8WZ73 363 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRORYQ9H606 182 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM204AQ9H8W3 233 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A13Q9UJS0 675 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SARDHQ9UL12 918 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTN6Q9UQ52 1028 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASXL3Q9C0F0 2248 aa13.56□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOCK9Q9BZ29 2069 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRP8O43159 456 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED7O43513 233 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDC3O75056 442 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACP1P24666 158 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R2P41236 205 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OXCT1P55809 520 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTN1Q12860 1018 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTI2Q6NXR4 508 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM110Q86TL2 294 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAP1Q92560 729 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED15Q96RN5 788 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THAP9Q9H5L6 903 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLCA2Q9UQC9 943 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALOX15BO15296 676 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP9BO43861 1147 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRINP1O60477 761 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRB1P04280 392 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A3P11169 496 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNA15P30679 374 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CENPCQ03188 943 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNH2Q12809 1159 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCLQ13371 301 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAT4Q14765 748 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF5Q15542 800 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROX2Q3B8N5 592 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISM2Q6H9L7 571 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL10Q6JEL2 608 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL22Q6P050 247 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM59Q8IWR1 403 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF606Q8WXB4 792 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC39A7Q92504 469 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIGD1Q96MW7 591 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPM1HQ9ULR3 514 aa13.55□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KALRNO60229 2985 aa13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms