RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 ACTN2P35609 894 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CFHR1Q03591 330 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 KCNH2Q12809 1159 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CNTN1Q12860 1018 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 OVGP1Q12889 678 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 AGBL4Q5VU57 503 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 BEND5Q7L4P6 421 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 TRIM69Q86WT6 500 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 SPATA32Q96LK8 384 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 DMTF1Q9Y222 760 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.68□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 RNF103O00237 685 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 PMM2O15305 246 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 SLC7A4O43246 635 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 MOCS3O95396 460 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 PDGFRAP16234 1089 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 DGKAP23743 735 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CXADRP78310 365 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 E2F1Q01094 437 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 SPAG5Q96R06 1193 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 U3KQA8 63 aa14.67□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 A0A1W2PQ27 194 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 A0A1W2PQ64 194 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 ATP9BO43861 1147 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 MYF5P13349 255 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 NUDT1P36639 197 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 FMO5P49326 533 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 SLC12A1Q13621 1099 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 STAT4Q14765 748 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 TAF5Q15542 800 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 OR4C6Q8NH72 309 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 MCF2LO15068 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 OPA1O60313 960 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CTSLP07711 333 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CKMT1AP12532 417 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 IRAK1P51617 712 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 KCNMA1Q12791 1236 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 PNOCQ13519 176 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 STILQ15468 1287 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 DLG2Q15700 870 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 FBXL22Q6P050 247 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 RRAGAQ7L523 313 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CHSY1Q86X52 802 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 WBP1Q96G27 269 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 NOX5Q96PH1 765 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 CEP83Q9Y592 693 aa14.65□□□□□ -0.06
NFE4-201ENST00000420058 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 A0A1B0GVM2 712 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 J3QKU1 62 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 CAPN9O14815 690 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 MAGEC1O60732 1142 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 MT-CO1P00395 513 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 MPOP05164 745 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 NNMTP40261 264 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 SULT2A1Q06520 285 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 ZNF284Q2VY69 593 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.64□□□□□ -0.07
NFE4-201ENST00000420058 TMEM110Q86TL2 294 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms