RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-210	ENST00000415055	LY9	Q9HBG7	655 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	POLH	Q9Y253	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	IPP	Q9Y573	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRK-210	ENST00000415055		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ARL5C	A6NH57	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055		A6NNZ2	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CHMP2A	O43633	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SGTA	O43765	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF623	O75123	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ECI2	O75521	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	EPN2	O95208	641 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	APOL3	O95236	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CEBPB	P17676	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SERPINB3	P29508	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MPL	P40238	635 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MLH1	P40692	756 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CCT5	P48643	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SCNN1G	P51170	649 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ADCY7	P51828	1080 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CREB5	Q02930	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SURF1	Q15526	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PSMD5	Q16401	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GAD1	Q99259	594 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RASA4B	C9J798	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HIP1	O00291	1037 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF263	O14978	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RASA4	O43374	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ERLIN2	O94905	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CAVIN2	O95810	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FSHB	P01225	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LPL	P06858	475 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RHO	P08100	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CHRNB1	P11230	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PEX2	P28328	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HOXC13	P31276	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MGAT2	Q10469	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	STK3	Q13188	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ELF2	Q15723	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	UGCG	Q16739	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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