RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391046.1

RNU6-1300P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1300, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1300P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZNF766Q5HY98 468 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 AADACL2Q6P093 401 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PCSK4Q6UW60 755 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ADAMTS15Q8TE58 950 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ASB2Q96Q27 587 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FCRL5Q96RD9 977 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 EYA3Q99504 573 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TM2D2Q9BX73 214 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 USP44Q9H0E7 712 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 HCN3Q9P1Z3 774 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 INSL6Q9Y581 213 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 AOX1Q06278 1338 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 C1QL1O75973 258 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 HLA-DQA2P01906 255 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 URODP06132 367 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CHRM4P08173 479 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 INHBCP55103 352 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 DCAF7P61962 342 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RHAGQ02094 409 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZBTB16Q05516 673 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MTA1Q13330 715 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 KRT32Q14532 448 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 IL13RA2Q14627 380 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SLC18A3Q16572 532 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 C10orf76Q5T2E6 689 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 HAUS3Q68CZ6 603 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MON1AQ86VX9 555 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 KLBQ86Z14 1044 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FAM47BQ8NA70 645 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SETD9Q8NE22 299 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 IP6K1Q92551 441 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PIGKQ92643 395 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PDCL3Q9H2J4 239 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 VEZTQ9HBM0 779 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 Q9N2J8 555 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SCINQ9Y6U3 715 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PER2O15055 1255 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PROP1O75360 226 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PLAUP00749 431 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 UBL4AP11441 157 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FCGR2AP12318 317 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ST6GAL1P15907 406 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RPS6KB1P23443 525 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PTH2RP49190 550 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TUBA4AP68366 448 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZXDAP98168 799 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TFF2Q03403 129 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 KLF10Q13118 480 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FHL2Q14192 279 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PLK5Q496M5 336 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FCRLBQ6BAA4 426 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GGNQ86UU5 652 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SCAIQ8N9R8 606 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RAB40AQ8WXH6 277 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 KAT2BQ92831 832 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 C5orf34Q96MH7 638 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 UPB1Q9UBR1 384 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1300P-201ENST00000391046 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms