RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

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Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 CD48P09326 243 aa3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 TMEM253P0C7T8 217 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MYBL1P10243 752 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RARAP10276 462 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SRCP12931 536 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RHOQP17081 205 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GOT1P17174 413 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 SLC12A1Q13621 1099 aa3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 TRIM14Q14142 442 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC6Q16204 474 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SMTNL2Q2TAL5 461 aa3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 PLA2G2CQ5R387 149 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ERMARDQ5T6L9 678 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 AFMIDQ63HM1 303 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LINGO4Q6UY18 593 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PRR23BQ6ZRT6 265 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 H2AFVQ71UI9 128 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLFN11Q7Z7L1 901 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 STK40Q8N2I9 435 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SH2D3CQ8N5H7 860 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DEFB119Q8N690 84 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NPWQ8N729 165 aa3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 SLC35G2Q8TBE7 412 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FAM71BQ8TC56 605 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 UCMAQ8WVF2 138 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 HMGB4Q8WW32 186 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TSC1Q92574 1164 aa3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 TBC1D31Q96DN5 1066 aa3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 NUP85Q9BW27 656 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZYG11BQ9C0D3 744 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC19Q9H756 370 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.56□□□□□ -1.84
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SNORD17-201ENST00000390930 DNAI1Q9UI46 699 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 VPS51Q9UID3 782 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ANAPC7Q9UJX3 599 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SARDHQ9UL12 918 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 USP18Q9UMW8 372 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CYP8B1Q9UNU6 501 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SCINQ9Y6U3 715 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CACNA1EQ15878 2313 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PCDH15Q96QU1 1955 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TRPM6Q9BX84 2022 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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