RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 TBX18O95935 607 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SHBGP04278 402 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ASNSP08243 561 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 HMOX1P09601 288 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GSTM5P46439 218 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 MTMR1Q13613 665 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 MEA1Q16626 185 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 CYS1Q717R9 158 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 CADM2Q8N3J6 435 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF560Q96MR9 790 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ILVBLA1L0T0 632 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PMM2O15305 246 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CIDEAO60543 219 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 OR7A10O76100 309 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PGLSO95336 258 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TNNI3P19429 210 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 OR3A3P47888 321 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 USP14P54578 494 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ABATP80404 500 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT73Q86Y46 540 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 IFT20Q8IY31 132 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TTLL6Q8N841 843 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 APOPT1Q96IL0 206 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MMS19Q96T76 1030 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC6Q99741 560 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC19Q9H756 370 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PQ72 361 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KLRF2D3W0D1 207 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF862O60290 1169 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PALMO75781 387 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO1DO94832 1006 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PF4V1P10720 104 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 IFI30P13284 250 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 NPR3P17342 541 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ARNTP27540 789 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 GPC1P35052 558 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 IRS1P35568 1242 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 RASSF2P50749 326 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 GPLD1P80108 840 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TFDP1Q14186 410 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 STARD3Q14849 445 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MB21D1Q8N884 522 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CDRT15Q96T59 188 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CRB3Q9BUF7 120 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 IDI2Q9BXS1 227 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 HIPK3Q9H422 1215 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 DIABLOQ9NR28 239 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNQ2O43526 872 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 HSF2BPO75031 334 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 CBR3O75828 277 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 PHKA2P46019 1235 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF33AQ06730 810 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.95□□□□□ -1.3
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