RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 SLC32A1Q9H598 525 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CBX8Q9HC52 389 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM59LQ9UK28 342 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SCML1Q9UN30 329 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CNTN5O94779 1100 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 VAV1P15498 845 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 NNMTP40261 264 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SHC2P98077 582 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 BNC1Q01954 994 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SULT2A1Q06520 285 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 BIRC7Q96CA5 298 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 FEM1AQ9BSK4 669 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 OR51B4Q9Y5P0 310 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 DOCK4Q8N1I0 1966 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 KNL1Q8NG31 2342 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 A0A1W2PP55 124 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CLDN11O75508 207 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 FSBPO95073 299 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CALB1P05937 261 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SLC8A1P32418 973 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CDH4P55283 916 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 NR1I3Q14994 352 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 ALFQ53S48 1182 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 FIGNQ5HY92 759 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF683Q8IZ20 524 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 FRS2Q8WU20 508 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 IQCDQ96DY2 449 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 AGPAT1Q99943 283 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 PLXNA2O75051 1894 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CHD8Q9HCK8 2581 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 PSMD8P48556 350 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 FOXC1Q12948 553 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 BNIPLQ7Z465 357 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM131Q92545 1883 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 A0A1B0GVT2 93 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 VASPP50552 380 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 GALCP54803 685 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SLC14A1Q13336 389 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 AADATQ8N5Z0 425 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 EMC1Q8N766 993 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 BAP1Q92560 729 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 C1orf74Q96LT6 269 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 OMDQ99983 421 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 ORAI3Q9BRQ5 295 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 IL21RQ9HBE5 538 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 TM9SF3Q9HD45 589 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 VPS28Q9UK41 221 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-201ENST00000378543 FAM47DPA6NHR8 397 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 DRGXA6NNA5 263 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SH3BP5O60239 455 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 IGHV4-34P06331 123 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 CD27P26842 260 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 FAM193AP78312 1265 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ARTNQ5T4W7 220 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA0895LQ68EN5 471 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 NCEH1Q6PIU2 408 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 LUZP1Q86V48 1076 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 FAM131BQ86XD5 332 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 CAMK1GQ96NX5 476 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 C11orf70Q9BRQ4 267 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 GAREM1Q9H706 876 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 MPP6Q9NZW5 540 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 WASF3Q9UPY6 502 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ATP9BO43861 1147 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ENDOD1O94919 500 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ADH1BP00325 375 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 IL1BP01584 269 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 RHOCP08134 193 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 C5AR1P21730 350 aa24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms