RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 C16orf89Q6UX73 402 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TIFABQ6ZNK6 161 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TTC7BQ86TV6 843 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 KBTBD6Q86V97 674 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SULF2Q8IWU5 870 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TERB1Q8NA31 727 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MCPH1Q8NEM0 835 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 KCNN1Q92952 543 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 VPS50Q96JG6 964 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 IER2Q9BTL4 223 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RSAD1Q9HA92 442 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9A2Q9UBY0 812 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.239e-6■■■■■ 68.9
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0J9YVX5 310 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GLRA3O75311 464 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 KRT10P13645 584 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RAG1P15918 1043 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 KCNA2P16389 499 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CPA2P48052 419 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MTTPP55157 894 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PSMC5P62195 406 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TUBA4AP68366 448 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 INSCQ1MX18 579 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZACNQ401N2 412 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf27AQ580R0 203 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 UBR7Q8N806 425 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ACTL9Q8TC94 416 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RTKNQ9BST9 563 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NUF2Q9BZD4 464 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 KLC2Q9H0B6 622 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PORCNQ9H237 461 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 STK39Q9UEW8 545 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 VPS28Q9UK41 221 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 LZTS1Q9Y250 596 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRA2Q96PE1 1338 aa7.36□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQH9 124 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 KBTBD13C9JR72 458 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 VILLO15195 856 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SLC16A4O15374 487 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RGS20O76081 388 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ADORA2AP29274 412 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PMLP29590 882 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TTKP33981 857 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ELK3P41970 407 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GABRB2P47870 512 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 COG7P83436 770 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP8P85298 464 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ROR1Q01973 937 aa7.35□□□□□ -1.23
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