RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 S100A14Q9HCY8 104 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TPP1O14773 563 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SERPINE1P05121 402 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L7P0C7H9 530 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 MGAT1P26572 445 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ERFP50548 548 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 COPAP53621 1224 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC25A3Q00325 362 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE1BQ01064 536 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 NAB1Q13506 487 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP2R3CQ969Q6 453 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 GBP5Q96PP8 586 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJC28Q9NX36 388 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL5CA6NH57 179 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP42A6NI28 874 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 M0QZ92 97 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SIN3BO75182 1162 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 USP1O94782 785 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO21O94952 628 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CHRNA1P02708 482 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 MYL4P12829 197 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 AKR1A1P14550 325 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 GRK2P25098 689 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 LHX1P48742 406 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SEMA3BQ13214 749 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PCLAFQ15004 111 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB41Q5JT25 222 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP4R1Q8TF05 950 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ERCC2P18074 760 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SCNN1GP51170 649 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNJLQ8IV13 435 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC9A7Q96T83 725 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 HHLA1C9JL84 531 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNK1O00180 336 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 NCAM1P13591 858 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNA4P22459 653 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CTGFP29279 349 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 OLIG2Q13516 323 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 INSCQ1MX18 579 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 GNASQ5JWF2 1037 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 BSPRYQ5W0U4 402 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 DHDDSQ86SQ9 333 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 NTAN1Q96AB6 310 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CNGB3Q9NQW8 809 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa24.41■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 C9IYK1 514 aa24.4■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 GJA9P57773 515 aa24.4■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SCAPQ12770 1279 aa24.4■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 BHLHA9Q7RTU4 235 aa24.4■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SYBUQ9NX95 663 aa24.4■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP350Q5VT06 3117 aa24.4■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 BTKQ06187 659 aa24.39■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 AP1ARQ63HQ0 302 aa24.39■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 RAPH1Q70E73 1250 aa24.39■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 MAVSQ7Z434 540 aa24.39■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 JADE3Q92613 823 aa24.39■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SORT1Q99523 831 aa24.39■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 GORASP1Q9BQQ3 440 aa24.39■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 IGSF9Q9P2J2 1179 aa24.39■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.39■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PROCP04070 461 aa24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PGAM1P18669 254 aa24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 IDH3AP50213 366 aa24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PGM2L1Q6PCE3 622 aa24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 NPWQ8N729 165 aa24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ACTRT2Q8TDY3 377 aa24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PGBD4Q96DM1 585 aa24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 VCX3BQ9H321 246 aa24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 LTFP02788 710 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ITGA2BP08514 1039 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 AIF1P55008 147 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PDSS2Q86YH6 399 aa24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-201ENST00000369862 C10orf107Q8IVU9 208 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms