RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365490.1

RN7SKP249-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP249, Length 355 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCNCP24863 283 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 STIP1P31948 543 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ETFBP38117 255 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 COILP38432 576 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 FNTAP49354 379 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 TNK2Q07912 1038 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 NR1H3Q13133 447 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 SERINC3Q13530 473 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CDH18Q13634 790 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 AAK1Q2M2I8 961 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANO4Q32M45 955 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC45A4Q5BKX6 768 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CTAGE6Q86UF2 777 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 MFN1Q8IWA4 741 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ADHFE1Q8IWW8 467 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CTAGE4Q8IX94 777 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CARNMT1Q8N4J0 409 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CPA6Q8N4T0 437 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 MMGT1Q8N4V1 131 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ATL2Q8NHH9 583 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 HAUS1Q96CS2 278 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 RTP4Q96DX8 246 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CHFRQ96EP1 664 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 HMCESQ96FZ2 354 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 PLK2Q9NYY3 685 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 NEU2Q9Y3R4 380 aa10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 COL4A3Q01955 1670 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 COL4A2P08572 1712 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A0A0MRY4 1105 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 MCF2LO15068 1137 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZMPSTE24O75844 475 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 MAP3K6O95382 1288 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 RHOCP08134 193 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 HLA-FP30511 346 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CD70P32970 193 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 GJA4P35212 333 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ACVRL1P37023 503 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 PTGIRP43119 386 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 LMNB2Q03252 620 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 IL10RBQ08334 325 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 LMAN2Q12907 356 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 SNX1Q13596 522 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 DMC1Q14565 340 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 NETO2Q8NC67 525 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 MAML1Q92585 1016 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 BHMTQ93088 406 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 LGMNQ99538 433 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 PDFQ9HBH1 243 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 THEGQ9P2T0 379 aa9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 MYO10Q9HD67 2058 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CFAP69A5D8W1 941 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 C5orf60A6NFR6 353 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 H7C0C1 242 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 DFFAO00273 331 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 MATN3O15232 486 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 MTSS1O43312 755 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 PRAMEF11O60813 436 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 TULP3O75386 442 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 BMP1P13497 986 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 GLULP15104 373 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 VAV1P15498 845 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 RBL1P28749 1068 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 OPRD1P41143 372 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 CSKP41240 450 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ATP5OP48047 213 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 KCNJ1P48048 391 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 TUBB4BP68371 445 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZP2Q05996 745 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 C2orf54Q08AI8 447 aa9.98□□□□□ -0.81
RN7SKP249-201ENST00000365490 WASHC5Q12768 1159 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms