RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 MTSS1LQ765P7 747 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TDHQ8IZJ6 230 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM159Q96B96 161 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MED4Q9NPJ6 270 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NR2E1Q9Y466 385 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 A6NNZ2 444 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 F8W810 466 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PSMB4P28070 264 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HTR1BP28222 390 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HMOX2P30519 316 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 STAT4Q14765 748 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 KIF19Q2TAC6 998 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SNX31Q8N9S9 440 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TSTD1Q8NFU3 115 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ISCUQ9H1K1 167 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.2□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TGM5O43548 720 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 GNA12Q03113 381 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 XRCC4Q13426 336 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 LONRF1Q17RB8 773 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC142Q17RM4 750 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SGO1Q5FBB7 561 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ATG16L1Q676U5 607 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 LRRC6Q86X45 466 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 DDIASQ8IXT1 998 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SMOQ99835 787 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF670Q9BS34 389 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NAT9Q9BTE0 207 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CHST7Q9NS84 486 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SUN2Q9UH99 717 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC31A1O15431 190 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 LRCH4O75427 683 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CIB2O75838 187 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MTA2O94776 668 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FSBPO95073 299 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ELFN1P0C7U0 828 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 KITP10721 976 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HALP42357 657 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CLCN6P51797 869 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 VSNL1P62760 191 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 UBXN11Q5T124 520 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ADGRF1Q5T601 910 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 USP6NLQ92738 828 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PLD4Q96BZ4 506 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ARMC5Q96C12 935 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TLR10Q9BXR5 811 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SDCBP2Q9H190 292 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CASS4Q9NQ75 786 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HACD1B0YJ81 288 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TMCC1O94876 653 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 RHOQP17081 205 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 C21orf59P57076 290 aa7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms