RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 SLC26A11Q86WA9 606 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 CHPFQ8IZ52 775 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 CYP4X1Q8N118 509 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 SVOPQ8N4V2 548 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 PAFAH2Q99487 392 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 KCNS3Q9BQ31 491 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 TMBIM4Q9HC24 238 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 CYP4F12Q9HCS2 524 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 SNTG2Q9NY99 539 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 PDP2Q9P2J9 529 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 RWDD3Q9Y3V2 267 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 MCIDASD6RGH6 385 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ANKRD65E5RJM6 399 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 QSOX1O00391 747 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 RGS14O43566 566 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 GRTP1Q5TC63 336 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 GGT7Q9UJ14 662 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 PIK3CDO00329 1044 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 OR10H2O60403 315 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 SLC25A12O75746 678 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 ANXA6P08133 673 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 NAA20P61599 178 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 BNC1Q01954 994 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 PPATQ06203 517 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 MPP3Q13368 585 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 SEZ6Q53EL9 994 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 MIIPQ5JXC2 388 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 SPANXN3Q5MJ09 141 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 TPGS1Q6ZTW0 290 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 C4orf19Q8IY42 314 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 MAGEB18Q96M61 343 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 KRT34O76011 436 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 SCTRP47872 440 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 NR2C2P49116 596 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 PRKAA2P54646 552 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 INHBEP58166 350 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 PKN1Q16512 942 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ERFP50548 548 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 SYT12Q8IV01 421 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 KLHL23Q8NBE8 558 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 APBA2Q99767 749 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 TINF2Q9BSI4 451 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 THAP2Q9H0W7 228 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ATRNO75882 1429 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 STX11O75558 287 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 IL6P05231 212 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ACADSP16219 412 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 PAGE2Q7Z2X7 111 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 EDEM1Q92611 657 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ABCC13Q9NSE7 274 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 COPG2Q9UBF2 871 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 OPTCQ9UBM4 332 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 FAM153AQ9UHL3 310 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 LOC100653049A0A140TA62 436 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 H3BN98 237 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 EPN2O95208 641 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 CATP04040 527 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ELMO1Q92556 727 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 ASB7Q9H672 318 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.62□□□□□ -1.51
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