RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 MIEF1Q9NQG6 463 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PTGES3LE9PB15 166 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPN7P35236 360 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 GSTM5P46439 218 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 MAPK10P53779 464 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTR3P61158 418 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ST8SIA6P61647 398 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 S100A12P80511 92 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CDRT15Q96T59 188 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM205CA6NFA0 338 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 C2CD2LO14523 706 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 EPN2O95208 641 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PDGFRAP16234 1089 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NOS3P29474 1203 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 IST1P53990 364 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ISLR2Q6UXK2 745 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NT5DC4Q86YG4 428 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D21Q8IYX1 336 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ADGRF4Q8IZF3 695 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.687e-7■■□□□ 13.4
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CD320Q9NPF0 282 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.683e-7■□□□□ 9.2
SH3BP2-201ENST00000356331 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ORC5O43913 435 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SATL1Q86VE3 508 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXW8Q8N3Y1 598 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM13CQ8NE31 585 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L15C9J2P7 530 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L11C9JVI0 530 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L18D6R9N7 530 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L22D6RA61 530 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L19D6RCP7 530 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L20D6RJB6 530 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 MLYCDO95822 493 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS7P62081 194 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L24Q0WX57 530 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L6PQ6QN14 398 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 HEG1Q9ULI3 1381 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1W2PQ72 361 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CST8O60676 142 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NME5P56597 212 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 C6orf183Q5T699 404 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PLCZ1Q86YW0 608 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC30A8Q8IWU4 369 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 IZUMO1Q8IYV9 350 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RIT1Q92963 219 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RHBDF1Q96CC6 855 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CLPBQ9H078 707 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ELOVL6Q9H5J4 265 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RGS14O43566 566 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FOSL2P15408 326 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGA7Q13683 1181 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 LZTR1Q8N653 840 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TEKT5Q96M29 485 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SPASTQ9UBP0 616 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CHADO15335 359 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNKO75909 580 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 STOMP27105 288 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PITPNAQ00169 270 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 MACC1Q6ZN28 852 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC7BQ86TV6 843 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 REEP2Q9BRK0 252 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP3A43Q9HB55 503 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ASB14A6NK59 587 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 DCXO43602 365 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RARAP10276 462 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF549Q6P9A3 640 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 GSTT2BP0CG30 244 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PLCL1Q15111 1095 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TAF5Q15542 800 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 XKR3Q5GH77 459 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ANO7Q6IWH7 933 aa10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms