RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340309.7

UBE2V1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,536 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1-201ENST00000340309 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.56□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.56□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TIPRLO75663 272 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 KCNH1O95259 989 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 GDF11O95390 407 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 HLA-DOAP06340 250 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 KRT3P12035 628 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 MATN1P21941 496 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 CNTFP26441 200 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 MIPP30301 263 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 EPHX2P34913 555 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 SCNN1DP51172 638 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 CRADDP78560 199 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TAP1Q03518 808 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 DMPKQ09013 629 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 RALGDSQ12967 914 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TRPC3Q13507 836 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 NEDD8Q15843 81 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 RAB6CQ53S08 254 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 CMC1Q7Z7K0 106 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 LRRC39Q96DD0 335 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 CCDC138Q96M89 665 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PEBP4Q96S96 227 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 MROQ9BYG7 248 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 NANOGQ9H9S0 305 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 MTMR10Q9NXD2 777 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 ITM2BQ9Y287 266 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 E7ENX8 843 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 NRP1O14786 923 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 METTL18O95568 372 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 NR4A1P22736 598 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 MYF6P23409 242 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PCYT1AP49585 367 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 LIG4P49917 911 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PRKCQQ04759 706 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 XKR9Q5GH70 373 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PERM1Q5SV97 790 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TREML2Q5T2D2 321 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PQLC3Q8N755 202 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TFAP2BQ92481 460 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 LPGAT1Q92604 370 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 GMCL1Q96IK5 515 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PSD2Q9BQI7 771 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 KLHL3Q9UH77 587 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.55□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 A6NL46 340 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TMEM114B3SHH9 223 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 G3V2L1 256 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 TADA2AO75478 443 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 JRKO75564 520 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 GCATO75600 419 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 CLPXO76031 633 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2V1-201ENST00000340309 IL18RAPO95256 599 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms