RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 SLC5A2P31639 672 aa25.81■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 TREML2Q5T2D2 321 aa25.81■■□□□ 1.72
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SENP3-201ENST00000321337 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa25.81■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 NMRAL1Q9HBL8 299 aa25.81■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 SCN1AP35498 2009 aa25.81■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
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SENP3-201ENST00000321337 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
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SENP3-201ENST00000321337 HDAC3O15379 428 aa25.77■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 TPH1P17752 444 aa25.77■■□□□ 1.72
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SENP3-201ENST00000321337 NAGLUP54802 743 aa25.77■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 IL23RQ5VWK5 629 aa25.77■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 SEL1L3Q68CR1 1132 aa25.77■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 OR6B3Q8NGW1 331 aa25.77■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 ATP6V1E2Q96A05 226 aa25.77■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 ZNF385DQ9H6B1 395 aa25.77■■□□□ 1.72
SENP3-201ENST00000321337 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.77■■□□□ 1.72
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