RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTGIRP43119 386 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF33AQ06730 810 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 JAMLQ86YT9 394 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM71DQ8N9W8 422 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRN4Q8WUT4 740 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTSS1O43312 755 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNCP24863 283 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCHO2Q0JRZ9 810 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHCR24Q15392 516 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM68Q6AZZ1 485 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL31Q6EBC2 164 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHBDF2Q6PJF5 856 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC13Q8IYE1 715 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 HTR3CQ8WXA8 447 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGF14Q92915 247 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFYVE19Q96K21 471 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPON2Q9BUD6 331 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB17Q9H0T7 212 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARK1Q9P0L2 795 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEPT10Q9P0V9 454 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 HPCAL4Q9UM19 191 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 DOCK4Q8N1I0 1966 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PENKP01210 267 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 TYRP14679 529 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAD2Q05329 585 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 NR1H3Q13133 447 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRM2Q14416 872 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 FIBINQ8TAL6 211 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCHCR1Q8TD31 782 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSGA13Q96PP4 275 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 EBF3Q9H4W6 596 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 SP110Q9HB58 689 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM50BQ9Y247 325 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 DENND4AQ7Z401 1863 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT14P02533 472 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADH5P11766 374 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC7A5Q01650 507 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERINC3Q13530 473 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 LEXMQ3ZCV2 418 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 NSMCE1Q8WV22 266 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASIC4Q96FT7 647 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 P2RY11Q96G91 374 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM83CQ9BQN1 747 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP29Q9HBJ7 922 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP13A1Q9HD20 1204 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP17A1P05093 508 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARSAP15289 507 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACVRL1P37023 503 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLCD3Q8N3E9 789 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPA6Q8N4T0 437 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR7D4Q8NG98 312 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASIC3Q9UHC3 531 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUMBLQ9Y6R0 609 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0D9SEW6 157 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAFKO60675 156 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEBLO76041 1014 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDI1P31150 447 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTK6Q13882 451 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 FSCBQ5H9T9 825 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF43Q68DV7 783 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM51Q9BSJ1 452 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDH9Q9HC56 1237 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS28Q9UK41 221 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHADO15335 359 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 VAV1P15498 845 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDF10P55107 478 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC12A1Q13621 1099 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 HTR4Q13639 388 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52K2Q8NGK3 314 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 WFDC5Q8TCV5 224 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERP44Q9BS26 406 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC2A11Q9BYW1 496 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ECT2Q9H8V3 914 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 DOCK8Q8NF50 2099 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 C2CD4DB7Z1M9 353 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANHXE9PGG2 379 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNK1O00180 336 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 MATN3O15232 486 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSKP41240 450 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 GUCY2DQ02846 1103 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL10RBQ08334 325 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms