RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301281.10

UBXN6-201, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-201ENST00000301281 CNTN5O94779 1100 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 ALDH1A2O94788 518 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 ABLIM3O94929 683 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 TIMP1P01033 207 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 RHOQP17081 205 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 DSG1Q02413 1049 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 RING1Q06587 406 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 CRYMQ14894 314 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 TMEM169Q96HH4 297 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 SERAC1Q96JX3 654 aa20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 MATN3O15232 486 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 FBXL22Q6P050 247 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 SH2D5Q6ZV89 423 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 CYS1Q717R9 158 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 CCNJLQ8IV13 435 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 BANPQ8N9N5 519 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 IGSF8Q969P0 613 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 NAT9Q9BTE0 207 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.46■□□□□ 0.87
UBXN6-201ENST00000301281 GOLGA8RI6L899 631 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 SLC1A5Q15758 541 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 MAGEB18Q96M61 343 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 UBP1Q9NZI7 540 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 HLA-DQB2P05538 268 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 TRIM49D1C9J1S8 452 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 KIAA0355O15063 1070 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 MT-ND3P03897 115 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 FOXN2P32314 431 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 KCNQ1P51787 676 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF276Q8N554 614 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 TTC17Q96AE7 1141 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 APOL2Q9BQE5 337 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 YIPF1Q9Y548 306 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 KRT37O76014 449 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 ZWINTO95229 277 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 PEX11BO96011 259 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 ACRP10323 421 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 LAG3P18627 525 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 NDST2P52849 883 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 IL9RQ01113 521 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 BMPR2Q13873 1038 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 TPGS2Q68CL5 300 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 HMCESQ96FZ2 354 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 FCRL5Q96RD9 977 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 GLOD4Q9HC38 313 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 HMX2A2RU54 273 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 DRGXA6NNA5 263 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 SLC18A2Q05940 514 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 PRPSAP1Q14558 356 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 CES3Q6UWW8 571 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 CHSY1Q86X52 802 aa20.43■□□□□ 0.86
UBXN6-201ENST00000301281 APOPT1Q96IL0 206 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms