RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296839.4

FOXQ1-201, Transcript of forkhead box Q1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXQ1, Length 2,309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1-201ENST00000296839 LVRNQ6Q4G3 990 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 OTOP3Q7RTS5 596 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 UNC5BQ8IZJ1 945 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC197Q8NCU1 140 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 CABS1Q96KC9 395 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 CLTBP09497 229 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 RHOQP17081 205 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 HHATQ5VTY9 493 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 TCP10LQ8TDR4 215 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 CEP295NLQ96MC4 621 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 CCSER2Q9H7U1 834 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 LRRC40Q9H9A6 602 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 TM9SF1O15321 606 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 NIPAL4Q0D2K0 466 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 IFT88Q13099 833 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 LRRC49Q8IUZ0 686 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 TOP1MTQ969P6 601 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 APOPT1Q96IL0 206 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF333Q96JL9 665 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 ZYG11BQ9C0D3 744 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 HMBSP08397 361 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 KIAA1841Q6NSI8 718 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 BFARQ9NZS9 450 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1-201ENST00000296839 PSMD3O43242 534 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 TLR5O60602 858 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 PYGBP11216 843 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 TUFMP49411 452 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 SERPINB9P50453 376 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 NEK3P51956 506 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 RING1Q06587 406 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 PDK4Q16654 411 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 SPANXN3Q5MJ09 141 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 RGS9BPQ6ZS82 235 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 DNAAF3Q8N9W5 541 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 MTBPQ96DY7 904 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 CLSTN3Q9BQT9 956 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 TMEM248Q9NWD8 314 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 UBP1Q9NZI7 540 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 ANKRD65E5RJM6 399 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 C2CD2LO14523 706 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 SNX3O60493 162 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 LPXNO60711 386 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 KRT38O76015 456 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 POLBP06746 335 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 RAP1GAP2Q684P5 730 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 FCRL5Q96RD9 977 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 OAS1P00973 400 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 NDST2P52849 883 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 ITIH4Q14624 930 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 ALFQ53S48 1182 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 GLOD4Q9HC38 313 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 WBP1LQ9NX94 342 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 SLC17A7Q9P2U7 560 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 CNTN5O94779 1100 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 SOD2P04179 222 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 ADRA1DP25100 572 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 BMPR2Q13873 1038 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 FBXL22Q6P050 247 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 CDKL2Q92772 493 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 IGSF8Q969P0 613 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 KIAA0754O94854 1291 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 NPY2RP49146 381 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 NAB1Q13506 487 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 CES3Q6UWW8 571 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 ANKS4BQ8N8V4 417 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 APOL2Q9BQE5 337 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 HMX2A2RU54 273 aa26.67■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 RFPL1O75677 317 aa26.67■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 SEC24AO95486 1093 aa26.67■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 CORO7P57737 925 aa26.67■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
FOXQ1-201ENST00000296839 SLC39A11Q8N1S5 342 aa26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms