RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 TLL1O43897 1013 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 TBL1XO60907 577 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SEC22BO75396 215 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CATP04040 527 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 DGKAP23743 735 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 PSMA3P25788 255 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 IL2P60568 153 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 UBE3AQ05086 875 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 RCN1Q15293 331 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 MAGED4Q96JG8 741 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 RNF157Q96PX1 679 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 FMO1Q01740 532 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 USP6NLQ92738 828 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 VAV3Q9UKW4 847 aa20.58■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ATP4AP20648 1035 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GRK4P32298 578 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CYP2A13Q16696 494 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NPNTQ6UXI9 565 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 VPS33AQ96AX1 596 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CATSPER2Q96P56 530 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ARL15Q9NXU5 204 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 DERAQ9Y315 318 aa20.58■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 BRCC3P46736 316 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NEK2P51955 445 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 OPTCQ9UBM4 332 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 YDJCA8MPS7 323 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GSTM1P09488 218 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CCNB1P14635 433 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NOMO3P69849 1222 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 DDR2Q16832 855 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 FAM35AQ86V20 835 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GPSM1Q86YR5 675 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.886e-7■■■□□ 18.5
USP25-202ENST00000285681 RIPK3Q9Y572 518 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ARHGEF9O43307 516 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SNHG28P0DPA3 235 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CTSEP14091 401 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ATP6V1B2P21281 511 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 POU1F1P28069 291 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CREG2Q8IUH2 290 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 FAM50BQ9Y247 325 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RPS7P62081 194 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 INSCQ1MX18 579 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ASB2Q96Q27 587 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ASB8Q9H765 288 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 STK39Q9UEW8 545 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NDOR1Q9UHB4 597 aa20.57■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 A0A087X1B8 175 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 KYQ8NBH2 561 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TLR5O60602 858 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 HYIQ5T013 277 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 C12orf29Q8N999 325 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ZNF670Q9BS34 389 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 DUSP16Q9BY84 665 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 USE1Q9NZ43 259 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TGFB1I1O43294 461 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NFKB1P19838 968 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SKP1P63208 163 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TRIM60Q495X7 471 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TTC7BQ86TV6 843 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TTPALQ9BTX7 342 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CLDN5O00501 218 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CYP7B1O75881 506 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms