RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 CHST12Q9NRB3 414 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 NFU1Q9UMS0 254 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 PROCRQ9UNN8 238 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 SLC38A8A6NNN8 435 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 NEURL1O76050 574 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TNFRSF6BO95407 300 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 IFNA2P01563 188 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CYP3A4P08684 503 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TDO2P48775 406 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ALG10Q5BKT4 473 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 RTL10Q7L3V2 364 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 KDELC2Q7Z4H8 507 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 C7orf57Q8NEG2 295 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 HMGB4Q8WW32 186 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 MIB2Q96AX9 1013 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 IL21RQ9HBE5 538 aa3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 MCIDASD6RGH6 385 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 PLIN1O60240 522 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TGFB3P10600 412 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 PLA2G2AP14555 144 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CYP3A7P24462 503 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ZXDBP98169 803 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ALDH1L2Q3SY69 923 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 WASHC2DQ5SRD0 308 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 GGT6Q6P531 493 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 PARM1Q6UWI2 310 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 Q6ZTK2 550 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 KRT77Q7Z794 578 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 KLBQ86Z14 1044 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 FAM186BQ8IYM0 893 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC89Q8N998 374 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 STYXQ8WUJ0 223 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 NEUROG1Q92886 237 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 MAGEH1Q9H213 219 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 YY1AP1Q9H869 796 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 LZTS1Q9Y250 596 aa3.37□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 AGAP5A6NIR3 686 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 C4orf47A7E2U8 309 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 SPTLC2O15270 562 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 SLC28A2O43868 658 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 IGHDP01880 384 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 PPM1AP35813 382 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TECP42680 631 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 RFX2P48378 723 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC25Q86WR0 208 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TTC14Q96N46 770 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ISCUQ9H1K1 167 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ARFGAP3Q9NP61 516 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ARL15Q9NXU5 204 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.36□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 DYTNA2CJ06 578 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 NPHP1O15259 732 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 LARGE1O95461 756 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 GYS1P13807 737 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TNFRSF8P28908 595 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CHRNA5P30532 468 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 PEX19P40855 299 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 KCNJ4P48050 445 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TRAPPC10P48553 1259 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ADPRHP54922 357 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 BTKQ06187 659 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 GPR18Q14330 331 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 SPARCL1Q14515 664 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 Q5PR19 223 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 TAF3Q5VWG9 929 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 SMRP1Q8NCR6 262 aa3.35□□□□□ -1.87
GPBP1-201ENST00000264779 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms