RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260795.6

FGFR3-201, Transcript of fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGFR3, Length 4,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3-201ENST00000260795 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.66□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 CLUHO75153 1309 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 ALDH1A1P00352 501 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 BPGMP07738 259 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 CYGBQ8WWM9 190 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 NT5MQ9NPB1 228 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 PADI3Q9ULW8 664 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 E2F6O75461 281 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 C22orf31O95567 290 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 METTL18O95568 372 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 SETSIPP0DME0 302 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 CSH1P0DML2 217 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 CSH2P0DML3 217 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 ERCC2P18074 760 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 ELMOD1Q8N336 334 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 SEPT8Q92599 483 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 AZIN2Q96A70 460 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 SYT11Q9BT88 431 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 E5RI56 91 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 NR2C2P49116 596 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 ITGA7Q13683 1181 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 FUT11Q495W5 492 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 PACS1Q6VY07 963 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.65□□□□□ -0.06
FGFR3-201ENST00000260795 E7ENQ6 273 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CLPTM1O96005 669 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 LTFP02788 710 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 NRF1Q16656 503 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TDRPQ86YL5 185 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 MPP5Q8N3R9 675 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ZNF358Q9NW07 568 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 MTSS1O43312 755 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 HOXC6P09630 235 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 SPATA31D3P0C874 917 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 IL10P22301 178 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ASPAP45381 313 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 INHBEP58166 350 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CTBP1Q13363 440 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 MAPRE2Q15555 327 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TUBGCP3Q96CW5 907 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 GPAMQ9HCL2 828 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 AK5Q9Y6K8 562 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 A8MX80 341 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CBX4O00257 560 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 FGFR3P22607 806 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 NDUFV1P49821 464 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 NOGQ13253 232 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 HPS6Q86YV9 775 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CXorf38Q8TB03 319 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 UCMAQ8WVF2 138 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 PCYT2Q99447 389 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ZNF711Q9Y462 761 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 PEX11AO75192 247 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ATP6AP2O75787 350 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 NFKB1P19838 968 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TUBP50607 506 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 BFSP2Q13515 415 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 WLSQ5T9L3 541 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.078e-7■■■■□ 24.7
FGFR3-201ENST00000260795 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CNDP1Q96KN2 507 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ZNF570Q96NI8 536 aa14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms