RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249806.10

CLN6-201, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN6, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-201ENST00000249806 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 C7orf26Q96N11 449 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 HAPLN3Q96S86 360 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 SQORQ9Y6N5 450 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 ZBTB16Q05516 673 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 SKA1Q96BD8 255 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 CCDC78A2IDD5 438 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 BIRC5O15392 142 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 USP1O94782 785 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 EOMESO95936 686 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 TYK2P29597 1187 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 CYP2C18P33260 490 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 ABCG1P45844 678 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 TTC7BQ86TV6 843 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 CEP57Q86XR8 500 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 ZNF778Q96MU6 729 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 CPNE1Q99829 537 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.12■■□□□ 1.13
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CLN6-201ENST00000249806 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 GRK4P32298 578 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 ARL8BQ9NVJ2 186 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 ZNF358Q9NW07 568 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 MPP6Q9NZW5 540 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 GLRA3O75311 464 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 CABYRO75952 493 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 KCNA4P22459 653 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 CCNCP24863 283 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 STX3Q13277 289 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 E2F5Q15329 346 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 GRTP1Q5TC63 336 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 MANEALQ5VSG8 457 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 C14orf80Q86SX3 495 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 DCLK2Q8N568 766 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 INPP5DQ92835 1189 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.11■■□□□ 1.13
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CLN6-201ENST00000249806 MAFKO60675 156 aa22.11■■□□□ 1.13
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CLN6-201ENST00000249806 TUBP50607 506 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 COG7P83436 770 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 GPR152Q8TDT2 470 aa22.11■■□□□ 1.13
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CLN6-201ENST00000249806 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.1■■□□□ 1.13
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CLN6-201ENST00000249806 TSGA13Q96PP4 275 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 IL22Q9GZX6 179 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 SNX15Q9NRS6 342 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.1■■□□□ 1.13
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CLN6-201ENST00000249806 ITM2AO43736 263 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 DNAJC6O75061 913 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 HOXC13P31276 330 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 RASSF2P50749 326 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 USP46P62068 366 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 CDH17Q12864 832 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 KCNMB4Q86W47 210 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 B3GALT6Q96L58 329 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 SRRDQ9UH36 339 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-201ENST00000249806 MAGEB16A2A368 324 aa22.09■■□□□ 1.13
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