RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 IRF5Q13568 498 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 GPR141Q7Z602 305 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 VPS45Q9NRW7 570 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 USP43Q70EL4 1123 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF516Q92618 1163 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 FZD8Q9H461 694 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 I3L4J1 428 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 RALAP11233 206 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 JAK1P23458 1154 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 GRK4P32298 578 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 MXI1P50539 228 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 EFNA5P52803 228 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 IFITM2Q01629 132 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CYP24A1Q07973 514 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 ITGADQ13349 1161 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 AMHR2Q16671 573 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 SPATA17Q96L03 361 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CCDC138Q96M89 665 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 PALMDQ9NP74 551 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CHEK2O96017 543 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CYP1A2P05177 515 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CTSHP09668 335 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 HSPA13P48723 471 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 TUBB3Q13509 450 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 TRIM16LQ309B1 348 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 FGD3Q5JSP0 725 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 SEMA4DQ92854 862 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 FBXL18Q96ME1 805 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 OLFM1Q99784 485 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 SPC25Q9HBM1 224 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 COL1A2P08123 1366 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CFAP99D6REC4 459 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 H0YCG3 227 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 H3BMQ9 156 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 ACKR2O00590 384 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 GPR32O75388 356 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 MT-ND3P03897 115 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 GARTP22102 1010 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 NR4A1P22736 598 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 TMPRSS15P98073 1019 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 MOGQ16653 247 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 TEX44Q53QW1 395 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 COG8Q96MW5 612 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 GOLGA8SH3BPF8 625 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 TOM1L1O75674 476 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 C8BP07358 591 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 MYL7Q01449 175 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 GAD2Q05329 585 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 SH2D5Q6ZV89 423 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 ITIH5Q86UX2 942 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 KAT5Q92993 513 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 PKP2Q99959 881 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC13-201ENST00000243056 TIMM44O43615 452 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 FAM189A1O60320 539 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms