RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 POC5Q8NA72 575 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PRR23AA6NEV1 266 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MICAL2O94851 1124 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ASMTLO95671 621 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 KDELR1P24390 212 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 C16orf62Q7Z3J2 963 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TRABD2AQ86V40 505 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TMEM114B3SHH9 223 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TSPAN4O14817 238 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 IFNA14P01570 189 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CENPAP49450 140 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PURAQ00577 322 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MFSD5Q6N075 450 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 IKBIPQ70UQ0 350 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 EPS8L1Q8TE68 723 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SNX8Q9Y5X2 465 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 C2orf71A6NGG8 1288 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 IRF1P10914 325 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TUBA4AP68366 448 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SCARA3Q6AZY7 606 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 FITM2Q8N6M3 262 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TAAR1Q96RJ0 339 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PRRG3Q9BZD7 231 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 STAG3L1P0CL83 205 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ENOPH1Q9UHY7 261 aa10.36□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 EDF1O60869 148 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZNF605Q86T29 641 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 DPP10Q8N608 796 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CYP3A43Q9HB55 503 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MAN1C1Q9NR34 630 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 RGS18Q9NS28 235 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 KCNT2Q6UVM3 1135 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 FAM220BPB1ANY3 271 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 KLRC4O43908 158 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PCNAP12004 261 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ADIGQ0VDE8 80 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CASP12Q6UXS9 341 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 DPY30Q9C005 99 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ACTR8Q9H981 624 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 F8VP50 259 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 VAPBO95292 243 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 FGFR2P21802 821 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PQLC1Q8N2U9 271 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SPPL2AQ8TCT8 520 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 KIAA0408Q6ZU52 694 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ADGRF2Q8IZF7 708 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 HBP1O60381 514 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SFRP1Q8N474 314 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PBX1P40424 430 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ITGA1P56199 1179 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ECHDC2Q86YB7 292 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 KIFC1Q9BW19 673 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CRTAMO95727 393 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 F9P00740 461 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 GRIA4P48058 902 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 AMER2Q8N7J2 671 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CPB2Q96IY4 423 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TBCDQ9BTW9 1192 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TBC1D13Q9NVG8 400 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 DHRS12A0PJE2 317 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CALCAP01258 141 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 VCLP18206 1134 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NAA20P61599 178 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZFP69Q49AA0 526 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 C6orf52Q5T4I8 152 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 S100A14Q9HCY8 104 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZNF222Q9UK12 451 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 H3BN98 237 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ODC1P11926 461 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 BAG6P46379 1132 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NECAB2Q7Z6G3 386 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TTC30AQ86WT1 665 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 COX4I2Q96KJ9 171 aa10.35□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TSPAN16Q9UKR8 245 aa10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms